魏、蜀、吴三国的官僚制度各有不同，其中蜀国因自称汉室正统，所以与东汉的官制最为类似，但也略有区别。其中最明显的就是丞相这个官职。东汉朝廷是不设丞相的，最高级的文官是太傅，下设太尉、司徒和司空，统称三公，其中司徒就是由西汉的丞相演变而来。
但东汉真正的权力中枢在尚书台，因此不管是司徒还是太傅，只要不录尚书事就是虚职。赤壁之战前，曹操废黜三公，自封丞相，掌握了朝廷的一切军政大权。曹丕即位之后，汉朝灭亡，魏国建立。因顾虑丞相一职权力太重，曹丕于是废除丞相，重设三公，这就相当于基本恢复了原东汉的官制。
同时曹丕设立了中书省，负责诏令文书的起草工作，这样一来尚书台的职权就被大大削弱，因此魏国的尚书令完全不可与东汉的尚书令相提并论。中书省的一把手叫中书监，二把手叫中书令。
从公元221年魏国建立，到公元249年高平陵之变前后，刘放做了27年的中书监，孙资做了29年的中书令。他们天天呆在皇帝身边，与皇帝的亲近程度远超一般大臣。因此可以这么说，在魏国他们两人才是真宰相。
与曹魏相比，蜀国最大的特点就是相权过重，重到甚至连皇帝都成了摆设，就更别说朝中的其他官员了。诸葛亮既是丞相又是益州牧，还兼着司隶校尉，拥有开府治事之权。因此朝中正牌的尚书令还远没有丞相府长史权力大，武将也只有兼着丞相府的差事才不算虚职。
比如第一次北伐时，魏延的官职为镇北将军兼丞相司马，领凉州刺史。这个不起眼的丞相司马才是要害，马谡守街亭时也是靠着丞相参军的职务节制诸将，颇有点类似曹操在世时汉中的架构。
当年在名将云集的西路战区，督汉中事的却是丞相府长杜袭。别说徐晃和张郃这两位外姓将领，就连征西将军夏侯渊也得靠边站。也难怪有人说，中国历史上权力最大的两个丞相都出在了三国时期，一个曹操，一个诸葛亮，他们都是以霸府取代中央掌控军政。
因此在诸葛亮去世之后，蜀国也不再设置丞相一职，以昭示诸葛亮无人可及的地位。之后的蒋琬、费祎和姜维都是以大司马或大将军的官职辅政，这倒与东汉的官僚体制完全类似了。
跟魏蜀两国相比，吴国的官制最奇特，魏国没有的丞相，吴国有，蜀国没有的中书省，吴国也有。除此之外，吴国也有三公九卿，只是大多空置。孙权时代朝中的九卿一直丢三落四，从来就没齐全过。
吴国的第一任丞相是孙绍，不过这是在吴王时期，仅三年后孙绍就病死了，孙权命顾雍接替他，直到孙权称帝。顾雍出身于江东四大家族之一的吴郡顾氏，共做了近二十年的丞相。直到孙权称帝时，文官代表顾雍为丞相，张昭为辅吴将军，潘濬为太常，刘基为光禄勋，陈化为尚书令，吕岱为交州刺史。
不过在吴国，不管是丞相还是尚书令、中书令，职权都不重。吴国武将们的权力要明显重于文官，尤其是荆州牧陆逊。孙权迁都建业之后，荆州简直成了陆逊的独立王国，州内的军政事务孙权很少过问。
截止到孙权称帝时的武将系统，陆逊为上大将军、右都护，兼任荆州牧，诸葛瑾为大将军、左都护、领豫州牧，步骘为骠骑将军、领冀州牧。朱然为车骑将军，右护军领兖州牧，全琮为卫将军、左护军、领徐州牧，朱桓为前将军、领青州牧，朱据为左将军，潘璋为右将军。
这些人全都拥有有实打实的兵权，如此重武轻文，与吴国的兵制有很大的关系。魏、蜀、吴三国都是世兵制，吴国尤其典型。很多家庭都是世代当兵，父死子继，兄终弟及，被称为兵户。
兵户与民户是分开登记的，有专门的机构负责管理，他们地位很低，终身生活在军营中，甚至不准与普通的百姓通婚，一人逃亡，全家连坐。孙权经常拿兵户作为奖励，赏赐给立有战功的武将。
长此以往，导致这些人手下的私人武装越来越庞大。石亭之战时，光朱桓手下的私兵就超过了一万人，就更别说大都督陆逊了。每遇大战，孙权都要指望这些人去冲锋陷阵，因此对他们是即用且防。
